在十二月十六日農委會發佈五十四隻「黑面琵鷺」的死因後，二十一日，陸續又有九隻黑面琵鷺因為感染肉毒桿菌死亡。年年過境台灣的黑面琵鷺，目前全球僅剩九百多隻，近年來台灣已成為保育與研究黑面琵鷺的重鎮，如今黑面琵鷺逢此一劫，不僅保育工作回到原點，未來如何防範類似事件，已為台灣保育工作帶來更大挑戰。
連日來，經各研究單位及學者專家進行臨床症狀檢查、細菌分離鑑定、組織病理檢查、毒物試驗等等檢驗後，十二月十六日農委會發佈新聞指出，黑面琵鷺確定死亡原因為Ｃ１型肉毒梭狀桿菌毒素中毒。至於黑面琵鷺為何會遭肉毒桿菌之害？農委會猜測，日前寒流來襲，導致黑面琵鷺棲地附近魚塭的養殖魚類死亡，由於腐魚體內含有「Ｃ１型肉毒梭狀桿菌毒素」，而今年飛抵台灣渡冬的黑面琵鷺又較往年多，原本只愛新鮮魚類的黑面琵鷺，因為食物需求量增加，在歷經長途跋涉後，可能為求裹腹，只得吞下腐敗魚肉。
From：【光華雜誌智慧藏】2003年1月號
黑面琵鷺死因確定後，排除了先前被懷疑的農藥毒害等人為因素，由於死亡的黑面琵鷺肚子內尚有食物，也澄清了「黑面琵鷺飢寒交迫凍斃」這一想當然耳的說法。
全世界數量不到一千隻的黑面琵鷺，國際「華盛頓公約組織」已將之列為一級瀕臨絕種動物。黑面琵鷺屬於朱鷺科鳥類，繁殖於中國東北與朝鮮半島，冬季時移棲至大陸華南、台灣、越南等地的開闊潮間帶活動。從十七年前鳥友首次在台南縣曾文溪河口七股濕地紀錄到黑面琵鷺，七股濕地已成黑面琵鷺的最愛，每年有高達五、六百隻的黑面琵鷺落腳此地。民國八十一年，七股鄉擬將此地劃定為工業區，在國內外保育人士力爭下，「為黑面舞者留下一塊淨土」成為國人共識，台南縣也改以發展生態旅遊為標的，黑面琵鷺棲地得以保存，學界相關研究與保育工作也陸續投入。
此後，在地方人士與鳥友努力下，每年黑面琵鷺依時前來，族群數量也維持穩定。今年入冬後，黑面琵鷺準時降臨，卻意外在牠們最信任的土地上發生集體中毒。十二月九日，入冬後最強烈的寒流來襲，當晚棲息地駐守人員就發現十幾隻黑面琵鷺陸續倒地，雖經緊急搶救，給予保溫，並餵以葡萄糖營養劑，黑面琵鷺仍死傷慘重。總計到十二月二十二日，已有七十幾隻琵鷺發病、六十三隻死亡。
黑面舞者集體暴斃，除了讓台灣海岸環境日漸惡化的問題再度凸顯，許多人則憂心，黑面琵鷺棲息地未被有效保護管理。尤其黑面琵鷺覓食區廣達五千公頃，近來政府僅只公告保護其中的八分之一，保護區環境監測系統尚未建立，週遭遊憩設施、蚵架與魚塭卻不斷增加。
其實，肉毒桿菌毒素原本就是遷徙性水禽最致命的病因，前台灣省家畜衛生試驗所所長劉培柏為文指出，七股濕地漁民常清理魚塭，排水乾涸，許多小魚和水生動物因此死亡腐敗，滋生肉毒桿菌；今年夏季極度乾旱，濕地水位陡降，潮間帶乾涸過久，大量死亡的魚類和無脊椎動物，成為土壤中常在性肉毒桿菌的滋生源。乾涸的陸地在冬季時，再為水浸泡，腐敗魚體中的毒素經水中無脊椎動物取食，或沈澱水底，被冬季來台的候鳥攝食，終於導致黑面琵鷺集體暴斃。更讓人憂心的是，在發現肉毒桿菌毒素污染的濕地，常會年年重複相同的野生水禽中毒事件。
由於黑面琵鷺的保育不僅涉及保育與發展的抉擇問題，身為擁有全世界七成黑面琵鷺落腳的國度，台灣對黑面琵鷺免於滅絕有多少危機意識？對此一「世界責任」有多少承擔的覺醒？是更根本的問題。
針對此，保育團體呼籲政府應儘速改善棲息地水位和水質、與拆除濕地上的違法魚塭、電線和蚵架；並倣傚國外水禽保護區的作法，如日本北海道丹頂鶴保護區，在食物短缺時，都有專人餵食新鮮魚餌，避免鳥兒因飢餓誤食腐敗魚類。
對於保育人士的質疑，農委會副主委李健全表示，這是一個慘痛的經驗，凸顯了野生動物棲息環境的管理有待加強，希望這一事件能更進一步喚起全民對保育工作的重視。農委會今年度也已編列經費，將配合台南縣政府籌設「黑面琵鷺保育研究中心」，希望建立更完善的場所、設備，研究與救治受傷的黑面琵鷺，讓保育工作的推動向前邁進。當然，對於關懷生態的人，更希望台灣的保育工作不只及於黑面琵鷺，因為這塊土地上的其他野生動物，一定也都希望得到人類的祝福。
