陳水扁總統於2005年7月28日第二度到東沙群島視察，並登上行政院海巡署巡防艇出航，展現維護國家領土、主權完整決心。他強調，政府高度重視維護東沙、南沙、其他海域所屬小島的國家主權、海域資源經營；不過，領土主權爭議、經濟海域重疊問題，應以協商代替對抗；期盼未來能成立東沙海洋國家公園。
總統由總統府秘書長游錫?、副秘書長馬永成、國防部長李傑、海巡署署長許惠祐等人陪同，視察東沙島，並為海洋巡防總局第5海巡隊東沙分隊揭牌。該分隊負有巡防、捍衛主權、加強生態保育之責。
From：尖端科技軍事新聞
雖然風浪不小，最大陣風達7級，總統仍按原定計畫，登上海巡署巡防艇出航，具體展現身為國家領導人，維護國家領土、主權決心。總統也在當地唯一廟宇「大王廟」贈匾、祈福；為東沙島種下象徵抗風、耐旱、常綠特質的胡桐樹；並與島上所有駐守的海巡官兵共進午餐。
總統表示，這是上任後第二次到東沙群島視察，也是過去從來沒有過的事，具體展現身為國家領導人，對於維護國家領土、主權完整決心與使命感。
總統強調，政府高度重視維護東沙、南沙、其他海域所屬小島、列嶼的國家主權、海域資源經營，未來將積極寬籌經費，持續強化海巡各項軟硬體建設，大幅提升海巡值勤、維護海域安全能量，早日實現「捍衛海洋、經營海洋、走向海洋」夢想。
此外，總統也表示，中國、香港漁船常侵入東沙群島環礁內，毒魚、炸魚，嚴重破壞東沙海洋生態，並以廢棄貨輪擱淺於環礁之上，企圖侵蝕台灣領土主權。且自2000年海巡署進駐以來，積極進行海域淨空，高雄市政府宣告全面禁止捕魚，加速當地魚群與海底珊瑚復育。現在已看到初步成果，令人欣慰。
因此，總統指出，希望海巡署能與相關漁業、學術研究單位合作，積極將東沙轉型為熱帶海洋生物與生態的研究中心，並朝向成立「東沙海洋國家公園」方向加速推動。
